朱棣与大报恩寺塔的事情被重提，是因为南京重建大报恩寺塔。而大报恩寺塔和上篇所聊的朱棣生母之谜一样，也很有故事。
历史上，大报恩寺曾经过多次重修复建。如康熙三年五月，即重建过寺的正殿，塔也多次修葺。近二十年来，南京一直计划恢复这个标志性建筑，重建大报恩寺塔。据方案主持东南大学古建筑专家潘谷西先生介绍，不是在原址，而是在原址的西侧建塔。
实际上早在1928年，民国专家即为重建大报恩寺塔作了准备，中央大学建筑系教授刘敦桢当年到琉璃窑址进行调查。1935年又有专家提出了重建构想。但因为日本侵华战争的爆发，此事搁置了，成了遗憾。如果不是那场战争，大报恩塔说不定已矗立在中华门外了——因为那时南京是中华民国首都，可以如朱棣一样，借“国力”重建。
从朱棣决定兴建塔，到现在重建，大报恩寺塔身上留下了太多的谜团。
谜团之一：朱棣建塔到底是想报谁之恩?
史书上讲得很清楚，朱棣为报母亲的养育之恩而建。
但具体谁是他的母亲，这里就很有学问了。近来出版的学术著作似乎为此事定了论，“明成祖朱棣为纪念其生母碽妃而建”。如中国古建筑权威潘谷西先生主编的《中国古代建筑史·元明卷》(第四卷)就持有这种观点，不久前笔者去拜访潘先生时，他还是这样说。
但《明史·成祖本纪》(卷5)明确称：“成祖启天弘道高明肇运圣武神功纯仁至孝文皇帝讳棣，太祖第四子也。母孝慈高皇后。洪武三年，封燕王。”这“孝慈高皇后”就是朱元璋的原配、著名的大脚皇后马秀英，而不是来自朝鲜的碽妃。
这样的记载是负责任的，朱棣生于元至正二十年四月十七(1360年5月2日)，地点在应天(今南京)，其时朱元璋不要说皇帝(1368年才称帝)了，连“王”都不是(1363年击败陈友谅后，次年才称“吴王”)，所以，大报恩寺及塔是朱棣为纪念其生母碽妃而建，有捕风捉影之嫌。
“为纪念其生母碽妃而建”一说，根源于野史。上篇中提到，传说碽妃是冤死的，作为亲生儿子朱棣本人又不能公开张扬，于是借报答母亲的养育之恩之名，建寺、塔纪念她。而这种说法的直接证据都是《南京太常寺志》上的文字，其中所载孝陵神位：“左一位淑妃李氏生懿文太子、秦愍王、晋恭王，右一位碽妃生成祖文皇帝，是皆享于陵殿，掌于祠官，三百年来未之有改者。”但是民间当时另有一说法，朱棣篡位，借“靖难之变”把侄儿朱允炆赶下皇位的一事，朝野上下都有抵触反感情绪，诽谤声音四起。其中有一种声音就是骂朱棣不是马皇后生养的，血统有问题，是杂种，不然不会对亲侄下此狠招。
在这种社会舆论压力下，朱棣一方面进行言论镇压，另一方面做出姿态。为了表明自己是马皇后所生，在迁都北京之际，于永乐十年(公元1412年)大兴土木，建大报恩寺、塔，以感谢马皇后的养育之恩，洗去身上的历史是非。
